最新成果揭示東亞人類(lèi)面部獨(dú)特性遺傳進(jìn)化機(jī)制

最新成果揭示東亞人類(lèi)面部獨(dú)特性遺傳進(jìn)化機(jī)制
最新成果揭示東亞人類(lèi)面部獨(dú)特性遺傳進(jìn)化機(jī)制
(神秘的最新制地球uux.cn報(bào)道)據(jù)復(fù)旦大學(xué)人類(lèi)表型組研究院:頭面部形態(tài)是一項(xiàng)由復(fù)雜形態(tài)組合形成的遺傳性狀。不同群體的成果傳進(jìn)頭面部特征具有顯著差異,與人類(lèi)的揭示重慶外圍(外圍經(jīng)紀(jì)) 外圍聯(lián)系(電話微信181-8279-1445)一二線城市快速安排上門(mén)外圍上門(mén)外圍女,全程30分鐘到達(dá)起源、遷徙及進(jìn)化具有緊密的東亞獨(dú)特關(guān)聯(lián)。東亞與歐洲人群面部形態(tài)差異顯著,人類(lèi)這背后受到怎樣的面部遺傳因素影響?是否存在自然選擇作用?同時(shí),人臉形態(tài)數(shù)據(jù)維度高且復(fù)雜,性遺如何結(jié)合數(shù)學(xué)與生物學(xué)進(jìn)行頭面部表型的化機(jī)量化? 
為了解決上述問(wèn)題,中科院上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所汪思佳研究員團(tuán)隊(duì)和中科院院士、最新制復(fù)旦大學(xué)金力教授團(tuán)隊(duì)聯(lián)合國(guó)內(nèi)外科研機(jī)構(gòu)對(duì)此展開(kāi)深入研究,成果傳進(jìn)在迄今為止最大規(guī)模的揭示東亞人群數(shù)據(jù)中,通過(guò)一套基于圖像分析與計(jì)算機(jī)算法的東亞獨(dú)特人類(lèi)頭面部特征自動(dòng)量化方法,進(jìn)行了頭面部表型與基因型的人類(lèi)相關(guān)分析。從遺傳與進(jìn)化的面部角度,解析了人類(lèi)頭面部表型差異熱點(diǎn)規(guī)律,性遺揭示了部分東亞獨(dú)特面部形態(tài)的遺傳作用機(jī)制,也定位出了造成歐亞面部差異的遺傳因素。
北京時(shí)間2022年4月7日晚,相關(guān)研究成果以《構(gòu)成東亞和歐洲人群面部形態(tài)差異的遺傳變異》(“Genetic variants underlying differences in facial morphology in East Asian and European populations”)為題發(fā)表于國(guó)際權(quán)威期刊《自然·遺傳學(xué)》(Nature Genetics)。
優(yōu)化表型量化,解析東亞面部遺傳結(jié)構(gòu)
研究人員基于近10,000例3D人臉圖像,首先構(gòu)建了一套結(jié)合解剖學(xué)信息的面部分割方法。將面部區(qū)域聚合為10塊主要結(jié)構(gòu),分別為額頭、眉弓、眼睛、顳部、顴部、鼻部、面頰、嘴上、嘴下以及下頜。這樣獲取的分割后面部表型能完美對(duì)應(yīng)到解剖學(xué)位置,為后續(xù)開(kāi)展遺傳學(xué)解析奠定了基礎(chǔ)。
人類(lèi)頭面部形態(tài)具有很高的遺傳度,人群間的面部差異究竟受到何種遺傳機(jī)制調(diào)控?利用多變量典型相關(guān)分析,研究者定位了244個(gè)影響東亞群體頭面部形態(tài)的重慶外圍(外圍經(jīng)紀(jì)) 外圍聯(lián)系(電話微信181-8279-1445)一二線城市快速安排上門(mén)外圍上門(mén)外圍女,全程30分鐘到達(dá)遺傳變異,證實(shí)面部特征作為典型的復(fù)雜性狀由多基因共同影響。通過(guò)與歐洲團(tuán)隊(duì)合作,進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)亞歐差異信號(hào)可能是功能同質(zhì),因頻率變化而造成的。
研究還發(fā)現(xiàn)頭面部相關(guān)基因主要富集在胚胎發(fā)育后期調(diào)控基因的增強(qiáng)子中,參與骨骼系統(tǒng)發(fā)育、區(qū)域化模式調(diào)控以及組織生成等功能。全表型組關(guān)聯(lián)分析(PheWAS)則發(fā)現(xiàn),影響面部形態(tài)的相關(guān)遺傳位點(diǎn)也影響著體成分、體質(zhì)和毛發(fā)等其他人體表型特征。
值得一提的是,本研究發(fā)現(xiàn),面部形態(tài)表型相關(guān)的位點(diǎn)rs6843082與房顫風(fēng)險(xiǎn)存在顯著關(guān)聯(lián),相關(guān)位點(diǎn)曾被報(bào)道可能影響心源性栓塞性中風(fēng)和缺血性中風(fēng),這提示我們——面部特征表型可能與心血管疾病的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)存在關(guān)聯(lián)。
創(chuàng)新可視方法,展現(xiàn)歐亞面部差異特點(diǎn)
相較于歐洲人,東亞人的面頰更突出,眉弓、鼻部和更為平緩。這種不同人群間面部差異的遺傳機(jī)制吸引著眾多學(xué)者深入探究。
為了挖掘亞歐人群的關(guān)鍵面部差異的遺傳基礎(chǔ),研究團(tuán)隊(duì)首次將多基因評(píng)分(Polygenic Score,PGS)的方法推廣到復(fù)雜形狀表型上,創(chuàng)新性地提出了多基因形狀分析(Polygenic Shape Analysis,PSA)方法,為面部形態(tài)的模擬提供了可視化基礎(chǔ)。
研究發(fā)現(xiàn)歐亞不同人群的真實(shí)面部形態(tài)差異與利用PSA模擬的由遺傳因素影響的歐亞特征一致性很高,進(jìn)而定位了13個(gè)影響東亞特有面部特征相關(guān)的遺傳因素。同時(shí),相關(guān)位點(diǎn)無(wú)論從效應(yīng)還是產(chǎn)生時(shí)間上而言,都能較好地符合東亞起源/衍生的猜測(cè)。
比如,rs8068343作為SOX9附近的獨(dú)立位點(diǎn),在歐亞之間具有顯著的頻率差異,造成鼻部更突出的基因型在歐洲占據(jù)主導(dǎo),研究者推測(cè)該位點(diǎn)很可能引起歐亞之間的鼻部差異,而SOX9附近的其余三個(gè)位點(diǎn)更多的影響人群內(nèi)部差異。
集成選擇分析,揭示鼻部適應(yīng)性選擇機(jī)制
這項(xiàng)研究利用了多種自然選擇分析方法,首次從遺傳角度挖掘了面部受到選擇的熱點(diǎn)區(qū)域,發(fā)現(xiàn)歐亞鼻部差異很可能由于在歐洲受到適應(yīng)性選擇,在東亞受到遺傳漂變導(dǎo)致。
這一結(jié)論揭示了自然選擇導(dǎo)致不同群體面部鼻子形狀產(chǎn)生差異的機(jī)制,同時(shí),提示研究者下一步可以結(jié)合古DNA及氣候數(shù)據(jù)開(kāi)展分析,將古人鼻部與眉弓形態(tài)的進(jìn)化與氣候變化構(gòu)建關(guān)聯(lián),為東亞人群體質(zhì)表型的復(fù)雜性和多樣性演化機(jī)制提供了新思路。
金力表示,本項(xiàng)成果是在人類(lèi)表型組計(jì)劃推進(jìn)過(guò)程中,以表型組學(xué)理念、范式和方法開(kāi)展生命科學(xué)研究的又一次成功嘗試。首次闡明了不同人群面部表型差異的潛在遺傳基礎(chǔ),大大拓展了東亞面部表型遺傳學(xué)的知識(shí),對(duì)人類(lèi)自身的認(rèn)識(shí)具有重大意義。
復(fù)旦大學(xué)人類(lèi)表型組研究院博士后張曼菲、復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院博士后吳思杰、中科院上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所博士生杜思源、復(fù)旦大學(xué)人類(lèi)表型組研究院博士后錢(qián)微為該論文共同第一作者,汪思佳研究員、李嘉睿博士和金力院士為該論文的共同通訊作者。
本研究得到中國(guó)科學(xué)院戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專(zhuān)項(xiàng)(B類(lèi))、上海市級(jí)科技重大專(zhuān)項(xiàng)“國(guó)際人類(lèi)表型組計(jì)劃(一期)”、國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)基金、中國(guó)博士后科學(xué)基金資助項(xiàng)目、國(guó)家科技基礎(chǔ)性工作專(zhuān)項(xiàng)、中國(guó)科學(xué)院創(chuàng)新交叉團(tuán)隊(duì)、CAMS醫(yī)學(xué)科學(xué)創(chuàng)新基金項(xiàng)目的共同資助。
原文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41588-022-01038-7
相關(guān)報(bào)道:學(xué)者定位出歐洲、東亞人面部差異遺傳因素
(神秘的地球uux.cn報(bào)道)據(jù)中新網(wǎng)上海4月8日電(記者 陳靜):東亞與歐洲人群面部形態(tài)差異顯著,這背后受到怎樣的遺傳因素影響?
中科院上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所汪思佳研究員團(tuán)隊(duì)和中科院院士、復(fù)旦大學(xué)金力教授團(tuán)隊(duì)聯(lián)合國(guó)內(nèi)外科研機(jī)構(gòu)對(duì)此展開(kāi)深入研究,對(duì)大規(guī)模的東亞人群數(shù)據(jù)中進(jìn)行頭面部表型與基因型的相關(guān)分析。他們揭示了部分東亞獨(dú)特面部形態(tài)的遺傳作用機(jī)制,定位出了造成歐亞面部差異的遺傳因素。
相關(guān)研究成果以《構(gòu)成東亞和歐洲人群面部形態(tài)差異的遺傳變異》為題,發(fā)表于最新一期國(guó)際權(quán)威期刊《自然·遺傳學(xué)》。金力表示,本項(xiàng)成果闡明了不同人群面部表型差異的潛在遺傳基礎(chǔ),大大拓展了東亞面部表型遺傳學(xué)的知識(shí),對(duì)人類(lèi)自身的認(rèn)識(shí)具有重大意義。
頭面部形態(tài)是一項(xiàng)由復(fù)雜形態(tài)組合形成的遺傳性狀。不同群體的頭面部特征具有顯著差異,與人類(lèi)的起源、遷徙及進(jìn)化具有緊密的關(guān)聯(lián)。相較于歐洲人,東亞人的面頰更突出,眉弓、鼻部更為平緩。這種不同人群間面部差異的遺傳機(jī)制吸引著眾多學(xué)者深入探究。
研究人員基于大量的3D人臉圖像,構(gòu)建了一套結(jié)合解剖學(xué)信息的面部分割方法。他們定位了244個(gè)影響東亞群體頭面部形態(tài)的遺傳變異,證實(shí)面部特征作為典型的復(fù)雜性狀由多基因共同影響。通過(guò)與歐洲團(tuán)隊(duì)合作,研究人員進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)亞歐差異信號(hào)可能是功能同質(zhì),因頻率變化而造成的。研究人員分析發(fā)現(xiàn),影響面部形態(tài)的相關(guān)遺傳位點(diǎn)也影響著體成分、體質(zhì)和毛發(fā)等其他人體表型特征。
本研究發(fā)現(xiàn),面部形態(tài)表型相關(guān)的位點(diǎn)rs6843082與房顫風(fēng)險(xiǎn)存在顯著關(guān)聯(lián),這提示:面部特征表型可能與心血管疾病的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)存在關(guān)聯(lián)。這項(xiàng)研究利用了多種自然選擇分析方法, 從遺傳角度挖掘了面部受到選擇的熱點(diǎn)區(qū)域,發(fā)現(xiàn)歐亞鼻部差異很可能由于在歐洲受到適應(yīng)性選擇,在東亞受到遺傳漂變導(dǎo)致。這一結(jié)論揭示了自然選擇導(dǎo)致不同群體面部鼻子形狀產(chǎn)生差異的機(jī)制;同時(shí)提示研究者下一步可以結(jié)合古DNA及氣候數(shù)據(jù)開(kāi)展分析,將古人鼻部與眉弓形態(tài)的進(jìn)化與氣候變化構(gòu)建關(guān)聯(lián),為東亞人群體質(zhì)表型的復(fù)雜性和多樣性演化機(jī)制提供了新思路。
據(jù)悉,本研究得到中國(guó)科學(xué)院戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專(zhuān)項(xiàng)(B類(lèi))、上海市級(jí)科技重大專(zhuān)項(xiàng)“國(guó)際人類(lèi)表型組計(jì)劃(一期)”、國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)基金、中國(guó)博士后科學(xué)基金資助項(xiàng)目、國(guó)家科技基礎(chǔ)性工作專(zhuān)項(xiàng)、中國(guó)科學(xué)院創(chuàng)新交叉團(tuán)隊(duì)、CAMS醫(yī)學(xué)科學(xué)創(chuàng)新基金項(xiàng)目的共同資助。
相關(guān)報(bào)道:科學(xué)家揭開(kāi)東亞面部獨(dú)特性遺傳進(jìn)化機(jī)制
(神秘的地球uux.cn報(bào)道)據(jù)中國(guó)科學(xué)報(bào)(張雙虎 黃辛):4月7日晚,《自然—遺傳學(xué)》發(fā)表中科院上海營(yíng)養(yǎng)與健康所研究員汪思佳團(tuán)隊(duì)和中科院院士、復(fù)旦大學(xué)教授金力團(tuán)隊(duì)聯(lián)合國(guó)內(nèi)外科研機(jī)構(gòu),關(guān)于東亞面部獨(dú)特性遺傳進(jìn)化機(jī)制方面的最新研究。
研究人員在迄今為止最大規(guī)模的東亞人群數(shù)據(jù)中,通過(guò)一套基于圖像分析與計(jì)算機(jī)算法的人類(lèi)頭面部特征自動(dòng)量化方法,進(jìn)行頭面部表型與基因型的相關(guān)分析。并從遺傳與進(jìn)化角度,解析了人類(lèi)頭面部表型差異熱點(diǎn)規(guī)律,揭示了部分東亞獨(dú)特面部形態(tài)的遺傳作用機(jī)制,也定位出造成歐亞面部差異的遺傳因素。
解析東亞面部遺傳結(jié)構(gòu)
頭面部形態(tài)是一項(xiàng)由復(fù)雜形態(tài)組合而成的遺傳性狀。不同群體的頭面部特征具有顯著差異,與人類(lèi)的起源、遷徙及進(jìn)化緊密關(guān)聯(lián)。東亞與歐洲人群面部形態(tài)差異顯著,這背后受到怎樣的遺傳因素影響?其中是否存在自然選擇作用?而且,人臉形態(tài)數(shù)據(jù)維度高且復(fù)雜,如何結(jié)合數(shù)學(xué)與生物學(xué)進(jìn)行頭面部表型的量化?
為解決上述問(wèn)題,研究人員基于近萬(wàn)例3D人臉圖像,構(gòu)建出一套結(jié)合解剖學(xué)信息的面部分割方法。他們將面部區(qū)域聚合為10塊主要結(jié)構(gòu),分別為額頭、眉弓、眼睛、顳部、顴部、鼻部、面頰、嘴上、嘴下以及下頜。這樣,獲取的分割后面部表型能完美對(duì)應(yīng)到各個(gè)解剖學(xué)位置,為后續(xù)開(kāi)展遺傳學(xué)解析奠定了基礎(chǔ)。
“人類(lèi)頭面部形態(tài)具有很高的遺傳度。” 汪思佳對(duì)《中國(guó)科學(xué)報(bào)》說(shuō),“我們要弄清的問(wèn)題是,人群間的面部差異究竟受到何種遺傳機(jī)制調(diào)控?”
研究團(tuán)隊(duì)利用多變量典型相關(guān)分析,定位了244個(gè)影響東亞群體頭面部形態(tài)的遺傳變異,證實(shí)面部特征作為典型的復(fù)雜性狀由多基因共同影響。此后,他們與歐洲團(tuán)隊(duì)合作,進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)亞歐人群之間的差異信號(hào)可能功能同質(zhì),只是因?yàn)轭l率變化所造成的。
“研究中,我們還發(fā)現(xiàn)頭面部相關(guān)基因主要富集在胚胎發(fā)育后期調(diào)控基因的增強(qiáng)子中,參與骨骼系統(tǒng)發(fā)育、區(qū)域化模式調(diào)控以及組織生成等功能。”該論文共同第一作者、復(fù)旦大學(xué)人類(lèi)表型組研究院博士后張曼菲說(shuō),“通過(guò)全表型組關(guān)聯(lián)分析(PheWAS)發(fā)現(xiàn),影響面部形態(tài)的相關(guān)遺傳位點(diǎn)也影響著體成分、體質(zhì)和毛發(fā)等其他人體表型特征。”
值得一提的是,本研究發(fā)現(xiàn)面部形態(tài)表型相關(guān)的一個(gè)基因位點(diǎn)(rs6843082)與房顫風(fēng)險(xiǎn)存在顯著關(guān)聯(lián)。
“相關(guān)位點(diǎn)曾被報(bào)道可能影響心源性栓塞性中風(fēng)和缺血性中風(fēng),這提示我們——面部特征表型可能與心血管疾病的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)存在關(guān)聯(lián)。”汪思佳說(shuō)。
展現(xiàn)歐亞面部差異
相較于歐洲人,東亞人的面頰更突出,眉弓、鼻部更為平緩。這種不同人群間面部差異的遺傳機(jī)制吸引著眾多學(xué)者深入探究。
為了挖掘亞歐人群的關(guān)鍵面部差異的遺傳基礎(chǔ),研究團(tuán)隊(duì)首次將多基因評(píng)分(PGS)方法推廣到復(fù)雜形狀表型上,創(chuàng)新性地提出了多基因形狀分析(PSA)方法,為面部形態(tài)的模擬提供了可視化基礎(chǔ)。
研究發(fā)現(xiàn),歐亞不同人群的真實(shí)面部形態(tài)差異與利用PSA模擬的由遺傳因素影響的歐亞特征一致性很高,進(jìn)而定位了13個(gè)影響東亞特有面部特征相關(guān)的遺傳因素。同時(shí),相關(guān)位點(diǎn)無(wú)論從效應(yīng)還是產(chǎn)生時(shí)間上而言,都能較好地符合東亞起源/衍生的猜測(cè)。
“比如,基因位點(diǎn)rs8068343作為SOX9附近的獨(dú)立位點(diǎn),在歐亞人群之間具有顯著的頻率差異,造成鼻部更突出的基因型在歐洲占據(jù)主導(dǎo)。”張曼菲補(bǔ)充說(shuō),“我們據(jù)此推測(cè),該位點(diǎn)很可能引起歐亞之間的鼻部差異,而SOX9附近的其余三個(gè)位點(diǎn)更多地影響人群內(nèi)部差異。”
揭示鼻部適應(yīng)性選擇機(jī)制
該研究利用了多種自然選擇分析方法,首次從遺傳角度挖掘了面部受到選擇的熱點(diǎn)區(qū)域,發(fā)現(xiàn)歐亞鼻部差異很可能由于在歐洲受到適應(yīng)性選擇,在東亞受到遺傳漂變導(dǎo)致。
“這一結(jié)論揭示了自然選擇導(dǎo)致不同群體面部鼻子形狀產(chǎn)生差異的機(jī)制。”汪思佳說(shuō),“同時(shí)也提示研究者下一步可以結(jié)合古DNA及氣候數(shù)據(jù)開(kāi)展分析,將古人鼻部與眉弓形態(tài)的進(jìn)化與氣候變化構(gòu)建關(guān)聯(lián),為東亞人群體質(zhì)表型的復(fù)雜性和多樣性演化機(jī)制提供新思路。”
金力表示,該成果是在人類(lèi)表型組計(jì)劃推進(jìn)過(guò)程中,以表型組學(xué)理念、范式和方法開(kāi)展生命科學(xué)研究的又一次成功嘗試。“首次闡明了不同人群面部表型差異的潛在遺傳基礎(chǔ),大大拓展了東亞面部表型遺傳學(xué)的知識(shí),對(duì)人類(lèi)自身的認(rèn)識(shí)具有重大意義”。
相關(guān)報(bào)道:復(fù)旦大學(xué)、中科院團(tuán)隊(duì)揭示東亞面部獨(dú)特性遺傳進(jìn)化機(jī)制
(神秘的地球uux.cn報(bào)道)據(jù)澎湃新聞(資深記者 張慧):不同群體的頭面部特征具有顯著差異,與人類(lèi)的起源、遷徙及進(jìn)化具有緊密的關(guān)聯(lián)。東亞與歐洲人群面部形態(tài)差異顯著,這背后受到怎樣的遺傳因素影響?是否存在自然選擇作用?
為了解決上述問(wèn)題,中科院上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所汪思佳研究員團(tuán)隊(duì)和中科院院士、復(fù)旦大學(xué)教授金力團(tuán)隊(duì)聯(lián)合國(guó)內(nèi)外科研機(jī)構(gòu)對(duì)此展開(kāi)深入研究,在迄今為止最大規(guī)模的東亞人群數(shù)據(jù)中,通過(guò)一套基于圖像分析與計(jì)算機(jī)算法的人類(lèi)頭面部特征自動(dòng)量化方法,進(jìn)行了頭面部表型與基因型的相關(guān)分析。從遺傳與進(jìn)化的角度,解析了人類(lèi)頭面部表型差異熱點(diǎn)規(guī)律,揭示了部分東亞獨(dú)特面部形態(tài)的遺傳作用機(jī)制,也定位出了造成歐亞面部差異的遺傳因素。
北京時(shí)間2022年4月7日晚,相關(guān)研究成果以《構(gòu)成東亞和歐洲人群面部形態(tài)差異的遺傳變異》(“Genetic variants underlying differences in facial morphology in East Asian and European populations”)為題發(fā)表于國(guó)際期刊《自然·遺傳學(xué)》(Nature Genetics)。該研究?jī)?yōu)化表型量化,解析東亞面部遺傳結(jié)構(gòu)。
解析東亞面部遺傳結(jié)構(gòu)
研究人員基于近10000例3D人臉圖像,首先構(gòu)建了一套結(jié)合解剖學(xué)信息的面部分割方法。將面部區(qū)域聚合為10塊主要結(jié)構(gòu),分別為額頭、眉弓、眼睛、顳部、顴部、鼻部、面頰、嘴上、嘴下以及下頜。這樣獲取的分割后面部表型能完美對(duì)應(yīng)到解剖學(xué)位置,為后續(xù)開(kāi)展遺傳學(xué)解析奠定了基礎(chǔ)。
人類(lèi)頭面部形態(tài)具有很高的遺傳度,人群間的面部差異究竟受到何種遺傳機(jī)制調(diào)控?利用多變量典型相關(guān)分析,研究者定位了244個(gè)影響東亞群體頭面部形態(tài)的遺傳變異,證實(shí)面部特征作為典型的復(fù)雜性狀由多基因共同影響。通過(guò)與歐洲團(tuán)隊(duì)合作,進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)亞歐差異信號(hào)可能是功能同質(zhì),因頻率變化而造成的。
研究還發(fā)現(xiàn)頭面部相關(guān)基因主要富集在胚胎發(fā)育后期調(diào)控基因的增強(qiáng)子中,參與骨骼系統(tǒng)發(fā)育、區(qū)域化模式調(diào)控以及組織生成等功能。全表型組關(guān)聯(lián)分析(PheWAS)則發(fā)現(xiàn),影響面部形態(tài)的相關(guān)遺傳位點(diǎn)也影響著體成分、體質(zhì)和毛發(fā)等其他人體表型特征。
值得一提的是,本研究發(fā)現(xiàn),面部形態(tài)表型相關(guān)的位點(diǎn)rs6843082與房顫風(fēng)險(xiǎn)存在顯著關(guān)聯(lián),相關(guān)位點(diǎn)曾被報(bào)道可能影響心源性栓塞性中風(fēng)和缺血性中風(fēng),這提示我們——面部特征表型可能與心血管疾病的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)存在關(guān)聯(lián)。
創(chuàng)新可視方法,展現(xiàn)歐亞面部差異特點(diǎn)
相較于歐洲人,東亞人的面頰更突出,眉弓、鼻部和更為平緩。這種不同人群間面部差異的遺傳機(jī)制吸引著眾多學(xué)者深入探究。
為了挖掘亞歐人群的關(guān)鍵面部差異的遺傳基礎(chǔ),研究團(tuán)隊(duì)首次將多基因評(píng)分(Polygenic Score,PGS)的方法推廣到復(fù)雜形狀表型上,創(chuàng)新性地提出了多基因形狀分析(Polygenic Shape Analysis,PSA)方法,為面部形態(tài)的模擬提供了可視化基礎(chǔ)。
研究發(fā)現(xiàn)歐亞不同人群的真實(shí)面部形態(tài)差異與利用PSA模擬的由遺傳因素影響的歐亞特征一致性很高,進(jìn)而定位了13個(gè)影響東亞特有面部特征相關(guān)的遺傳因素。同時(shí),相關(guān)位點(diǎn)無(wú)論從效應(yīng)還是產(chǎn)生時(shí)間上而言,都能較好地符合東亞起源/衍生的猜測(cè)。
比如,rs8068343作為SOX9附近的獨(dú)立位點(diǎn),在歐亞之間具有顯著的頻率差異,造成鼻部更突出的基因型在歐洲占據(jù)主導(dǎo),研究者推測(cè)該位點(diǎn)很可能引起歐亞之間的鼻部差異,而SOX9附近的其余三個(gè)位點(diǎn)更多的影響人群內(nèi)部差異。
集成選擇分析,揭示鼻部適應(yīng)性選擇機(jī)制
這項(xiàng)研究利用了多種自然選擇分析方法,首次從遺傳角度挖掘了面部受到選擇的熱點(diǎn)區(qū)域,發(fā)現(xiàn)歐亞鼻部差異很可能由于在歐洲受到適應(yīng)性選擇,在東亞受到遺傳漂變導(dǎo)致。
這一結(jié)論揭示了自然選擇導(dǎo)致不同群體面部鼻子形狀產(chǎn)生差異的機(jī)制,同時(shí),提示研究者下一步可以結(jié)合古DNA及氣候數(shù)據(jù)開(kāi)展分析,將古人鼻部與眉弓形態(tài)的進(jìn)化與氣候變化構(gòu)建關(guān)聯(lián),為東亞人群體質(zhì)表型的復(fù)雜性和多樣性演化機(jī)制提供了新思路。
金力表示,本項(xiàng)成果是在人類(lèi)表型組計(jì)劃推進(jìn)過(guò)程中,以表型組學(xué)理念、范式和方法開(kāi)展生命科學(xué)研究的又一次成功嘗試。首次闡明了不同人群面部表型差異的潛在遺傳基礎(chǔ),大大拓展了東亞面部表型遺傳學(xué)的知識(shí),對(duì)人類(lèi)自身的認(rèn)識(shí)具有重大意義。
復(fù)旦大學(xué)人類(lèi)表型組研究院博士后張曼菲、復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院博士后吳思杰、中科院上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所博士生杜思源、復(fù)旦大學(xué)人類(lèi)表型組研究院博士后錢(qián)微為該論文共同第一作者,汪思佳研究員、李嘉睿博士和金力院士為該論文的共同通訊作者。
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